《分子生物学技术》实验教学大纲
1.实验课程号:
2.课程属性:选修
3.实验属性:非独立设课
4.学时学分:18学时
5.实验应开学期:春季
6.先修课程:分子生物学
一、课程的性质与任务
分子生物学技术是兽医专业食品卫生检验方向的一门重要选修课。分子生物学技术实验是分子生物学技术重要教学环节之一。通过实验,一方面使学生进一步加深对分子生物学技术基本理论的理解,巩固所学的理论知识;另一方面,让学生了解分子生物学技术的一些研究方法,培养学生的实践操作能力,提高学生分析、解决问题的能力,为学好分子生物学技术及相关课程发挥相辅相成的作用。
二、实验的目的与基本要求
分子生物学技术实验综合性强,涉及面广,基本操作全面,教学中应达到以下基本目的和要求:
1.能通运用所学知识,切实领会实验原理;
2.掌握基本的实验方法和技能,熟练操作步骤,提高学生的实践操作能力;
3.训练学生独立观察、思考的习惯,能正确预测、分析实验中可能出现的结果,培养学生科学的思维方法和创新能力;
4.严格要求学生,认真对待实验,精心知识,独立进行实验操作,独立完成实验报告,使学生逐步养成严谨的学风,认真细致的工作态度,为以后的科学技术工作奠定基础。
三、实验考核方式及办法
(一)总则:实验课考核成绩占该门课程的40%,若实验课考核成绩达不到60分,则不能参加该门课程的期终考试。
(二)考核内容及成绩计分方法
1.课堂表现(40分)
① 考勤:迟到或早退每次扣5分,旷课一次扣l0分并交学工组老师处理。
②课堂纪律:参照实验守则,违反纪律每次扣10分并交学工组老师处理。
③卫生:课堂乱涂画者,每次扣10分,并清除之,课后卫生不符要求擅自离去者,每人每次扣5分。
2.实验报告成绩(60分)
实验报告应独立、按时完成,缺交一次扣10分,抄袭他人作业及被抄袭者一律记0分。
四、实验项目一览表
分子生物学技术课程实验项目一览表
序号 | 实验名称 | 实验类型 | 实验要求 | 适用 专业 | 学时 |
1 | 分子生物学常用仪器的使用和保养 | 综合 | 选修 | 食品卫生检验 | 4 |
2 | 动物组织中总DNA的提取与纯度鉴定 | 综合 | 选修 | 食品卫生检验 | 4 |
3 | PCR扩增 | 综合 | 选修 | 食品卫生检验 | 4 |
4 | 实验四 DNA的凝胶电泳 | 综合 | 选修 | 食品卫生检验 | 6 |
五、实验项目的内容
实验一 分子生物学常用仪器的使用方法与保养
1.本次实验的目的和要求
(1)熟悉和掌握分子生物学常用仪器的使用方法。
(2)了解和掌握分子生物学常用字仪器的保养方法。
2.实验内容
(1)分子生物学常用仪器的使用方法
(2)分子生物学常用仪器的保养方法
(3)分子生物学常用仪器使用时的注意事项
3.需要的仪器
(1)PCR扩增仪
(2)冷冻离心机
(3)紫外分光光度计
(4)凝胶成像系统
(5)超低温冰箱
(6)低温摇床
4.实验步骤
(1)先听老师讲解各仪器的使用方法、保养和注意事项。
(2)操作使用。
5.教学方式
教师讲解,学生独立操作 。
6.考核要求
掌握常用仪器的使用方法、保养及其注意事项
7.实验报告要求
(1)了解实验目的和要求。
(2)写出常用仪器的使用方法和注意事项。
实验二 动物组织中总DNA的提取与纯度鉴定
1.本次实验的目的和要求
学习动物DNA的提取方法和原理,以及DNA纯度的鉴定技术。
2.实验原理
在DNA的提取过程中,利用去污剂如SDS(十二烷基硫酸钠)使组织细胞裂解,并破坏蛋白质的二级、三级结构;利用蛋白酶个水解蛋白质;变性的蛋白质及多糖,脂类等杂质通过有机溶剂如苯酚/氯仿抽提而去除;再用氯仿抽提去除多余的酚;然后向含DNA的上清液加无水乙醇使DNA分子发生凝聚(脱水),最后通过离心得到DNA沉淀。
3.需要的仪器和试剂
(1)仪器
高速离心机、离心管、微加热系统、移液枪、紫外分光光度计。
(2)试剂
DNA提取液,饱和苯酚,氯仿:异戊醇混合液,无水乙醇,蛋白酶,TE 。
4.实验步骤
(1)动物DNA的提取
①取猪耳或其它组织器官约1.5g,洗干净,切碎,移至1.5ml离心管中。
②加入DNA提取液0.5ml
③加入蛋白酶K 15ml(蛋白酶K的浓度为10mg/ml),并充分混匀
④放于45℃摇床消化,转速120 rmp,以完全消化为准。
⑤加入等体积饱和酚,充分摇匀,10000 rmp离心5分钟,取上清液。
⑥加入等体积氯仿/异戊醇混合液,充分混匀,10000 rmp离心5分钟,取上清液。
⑦加入2倍体积冰冷的无水乙醇,轻轻混匀,7000 rmp离心2分钟,弃去上清液。
⑧加入适量TE溶解。
(2)DNA纯度及含量测定
5.教学方式
教师讲解,在老师的指导下,学生动手操作。
6.考核要求
(1)掌握动物DNA的提取方法。
(2)掌握DNA的浓度测定和质量检测方法
7.实验报告要求
(1)掌握实验的原理和操作步骤
(2)对实验结果进行详细分析
实验三 PCR扩增
1.本次实验的目的和要求
通过本实验的学习,使学生掌握PCR反应的基本原理和操作技术。
2.实验原理
聚合酶链式反应(PCR)的原理类似于DNA的天然复制过程。在微量模板DNA、引物、dNTP、耐热DNA聚合酶(Taq酶)和Mg2+等存在的情况下,经变性、退火和延伸若干个循环后,DNA可扩增2n倍,其扩增倍数可用以下公式表示:
Y=(1+X)n
Y:DNA扩增倍数 , X:扩增效率, n:循环次数。
3.需要的仪器及试剂
(1)仪器
PCR热循环仪、台式冷冻离心机、离心管、 移液枪和吸头。
(2)试剂
Taq DNA聚合酶,10×buffer(PCR缓冲液,dNTPs,石蜡油,MgCl2
4.实验步骤
(1)PCR反应体系(25ul):以猪的氟烷基因的扩增为例。
反应物 体积(ul) 母液浓度
①ddH2O 17.55
②10×buffer 2.5
③dNTPs 0.2 2mM
④引物1 0.8 5uM
⑤引物2 0.8 5uM
⑥MgCl2 1.5 25mM
⑦Taq聚合酶 0.25 5u/ul
⑧DNA模板 0.5 100ng/ul
(2)PCR反应程序
①94℃预变性: 4分钟
②94℃变性 : 1分钟
③64℃退火 : 1分钟 循环35次
④72℃延伸 : 1分钟
⑤72℃后延伸: 8分钟
⑥结束
5.教学方式
教师采用多媒体讲解,学生再动手操作。
6.考核要求
(1) 掌握PCR反应的原理
(2)掌握PCR反应程序的编写
7.实验报告要求
(1)按要求撰写实验报告
(2)分析实验结果
实验四 DNA的凝胶电泳
1.本次实验的目的和要求
学习和掌握DNA的凝胶电泳方法。
2.实验原理
带电物质在电场中向相反电极移动的现象称为电泳。DNA等生物大分子在一定的PH值条件下,可以解离成带电荷的离子,在电场中向相反电移动。
琼脂糖和聚丙烯酰胺作为支持介质的凝胶电泳应用最多,它们是分离,鉴定和纯化DNA和RNA片段的主要方法。琼脂糖比聚丙烯酰胺的分辩率低,但其分离范围广,约200bp~50kb的DNA通常在垂直水平装置上进行,聚丙烯酰胺分离小片段(5~500bp)的效果较好,一般在垂直装置上进行。
3.需要的仪器及试剂
(1)仪器
移液器,电泳仪,电泳槽,凝胶成像系统
(2)试剂
琼脂糖,50×TAE,溴化乙锭, 上样液
4.实验步骤
(1)用适明透胶将洗净,干燥的电泳凝胶床的两端开口封好。
(2)用电泳缓冲液在微波炉上溶解琼脂糖颗粒,熔化的琼脂糖溶液冷却至60℃时,加入溴化乙锭,其浓度为 0.5ul/ml,充分混匀。
(3)在胶膜放置好梳子后,将温热凝胶倒入胶膜中,倒胶时避免产生气泡,胶厚度为3~5mm.
(4) 凝胶固定后,小心移去梳子和胶带,将凝胶放入电泳槽。
(5)加入电泳缓冲液,使液面高出凝胶表面1~2mm。
(6) 将样品与上样缓冲液混合。
(7) 用微量移液器将样品加入孔内。
(8)电泳槽通电,在60~100V恒压下电泳。
(9)电泳完成后切断电源,取出凝胶,放于凝胶成像系统下的观察、拍照。
5.教学方式
教师讲解,并指导学生操作。
6.考核要求
(1) 掌握琼脂糖凝胶的制作方法
(2)掌握DNA的凝胶电泳方法
7.实验报告要求
(1)根据所学知识分析实验结果
(2)总结归纳本实验的注意事项
六、实验教材及主要参考资料
1.姜泊,张亚历,周殿元,分子生物学常用实验方法。人民军医出版社,1996。
2.熊远著主编,猪生化及分子遗传实验导论。中国农业出版社,1999。
七、教改说明及其他
分子生物学技术实验共18学时,为了培养学生独立操作、提高综合分析问题的能力,我们将4个独立实验设计成一个综合性实验:先了解仪器的使用,再提取动物的DNA,然后再对DNA样品进行PCR扩增,最后进行电泳检测,这样既节省人力、物力,又使实验之间增加了连贯性。
主撰人:黄生强
审核人:
分管教学院长:
2007年3月20日
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